تتعدد طرق تنظيف الأواني الزجاجية في المختبرات، منها الغسل اليدوي، والغسل بالموجات فوق الصوتية، والغسالات شبه الأوتوماتيكية، والغسالات الأوتوماتيكية. ومع ذلك، فإن جودة التنظيف هي العامل الحاسم في دقة التجربة التالية، بل وفي نجاحها. يلخص المحرر عدة عوامل رئيسية تؤثر على التنظيف، ويلخصها في خمس نقاط أساسية:

ج: الكيمياء
اختر مكونات مختلفة من المنظف وفقًا لغرض التنظيف.

T: درجة الحرارة 
بشكل عام، ستكون درجة حرارة الغسيل الأعلى هي الأفضل من حيث فعالية الغسيل

جودة المياه
يُعد الماء الوسيلة الرئيسية في عملية التنظيف، لكن جودة المياه تختلف من مكان لآخر، لذا لا يمكن ضمان فعالية التنظيف بشكل كامل.

م: القوة الميكانيكية
تتم إزالة البقايا من سطح الوعاء بواسطة قوى خارجية

T: الوقت
بشكل عام، كلما طالت مدة التنظيف، كان تأثير التنظيف أفضل.

مبدأ عمل غسالة الأواني الزجاجية الأوتوماتيكية: تسخين الماء، وإضافة منظف خاص عبر مضخة الدوران إلى أنابيب السلال الاحترافية بضغط منخفض ودوران عالٍ لتنظيف السطح الداخلي للأواني الزجاجية. أما السطح الخارجي، فيتم تنظيفه بواسطة أذرع رش علوية وسفلية. تعتمد الغسالة على وقت وخطوات تنظيف علمية لتحقيق هدف تنظيف الأواني الزجاجية بكفاءة.